Na základě Memoranda o spolupráci Univerzity Karlovy a Arcibiskupství pražského, které bylo podepsáno dne 4. 7. 2017, a na základě žádosti rektora Arcibiskupského semináře, Mgr. Jana Kotase, S.S.L. byl Akademickému senátu UK předložen návrh na osamostatnění Arcibiskupského semináře. Akademický senát Univerzity Karlovy dne 6. 10. 2017 rozhodl o zrušení Arcibiskupského semináře jako součásti Univerzity Karlovy s účinností ke dni 31. 12. 2017.
Vzhledem k tomuto faktu byla již 1. října 2017 založena nová církevní právnická osoba – Arcibiskupský seminář Praha.